埃博拉病毒的自然贮存宿主尚未完全 研究清楚为什么蝙蝠身上那么多病毒，但越来越多的科学证据表明， 果蝠（包括锤头果蝠、富氏前肩头果蝠与 小领果蝠）是埃博拉病毒的自然贮存宿 主。在非洲，感染埃博拉病毒的人与非人 类灵长类动物的地理分布与这些果蝠的活 动范围一致。
目前，埃博拉病毒在自然界的循环方式也尚未完全阐明。现有研究认为，埃博拉病毒主要在果蝠间循环、传播，偶尔可将病毒传染给黑猩猩、大猩猩等非人 类灵长类动物；另外，森林羚羊和豪猪等哺乳动物也可能感染，人类则通过接触这些动物而感染发病。此外，果蝠还可直接将埃博拉病毒传播给人。非洲曾有档案记载，有人因为处理感染或死去的大猩猩、黑猩猩、猴子等非人类灵长类动物而感染发病。
